Использовать WinPopup немного не удобно в плане окна внизу и то, что приходе сообщения окно не отрывается с сообщением. Однако есть другие разработки которые могут значительно улучшить этот процесс. По адресу:
http://viktorov.narod.ru/programming/myprograms/vikpopup/
Вы можете взять небольшую программу около 500. Никакой инсталляции не требуется достаточно ее просто запустить.
После запуска ее можно свернуть и она будет находиться в области SysTray.
Что уже значительно лучше, а в настройках указать, что нужно разворачивать окно при получении сообщения.
И теперь при получении сообщений окно программы будет на экране.