Два способа мы рассмотрели в "Шаг 216 - Боремся с удаленными записями – первый способ" и "Шаг 217 - Боремся с удаленными записями – второй способ".

Но есть еще один наиболее правильный на мой взгляд. В меню Администрирования есть исправление и тестирование ИБ.

При его выборе появится диалоговое окно с вариантами тестирования. Дело это хорошее. Можно проверить на наличие ошибок и все такое. Вот тут-то и есть вариант упаковки таблиц.

Упаковка должна привести к физическому удалению записей помеченных на удаление.