Обращаться к Счету можно точно так же как и в Дебете. Читайте "Шаг 127 - Изучаем операции - Дебет.Счет".

Укажем откуда деньги будут уходить.

Процедура ОбработкаПроведения()
	Операция.НоваяПроводка();
	Операция.Дебет.Счет=СчетПоКоду("90.3.3");
	Операция.Кредит.Счет = СчетПоКоду("68.1");
КонецПроцедуры